京都大学経済研究所は、1962年の設立以来、わが国の理論・計量経済学の研究において中心的な役割を果たしており、めざましい研究成果と人材を輩出している。常に第一級の研究業績を生み続けることを通じて、新たな研究パラダイムを提示し、優れた研究者をひきつける日本を代表する経済学研究の一大センターである。2005年度には、中央官庁との連携の下で先端政策分析研究センターを設置し、理論と実証の両面からの政策研究を推進している。さらに2007年度には「教育経済学研究部門（漢検）」および「伊藤清博士ガウス賞受賞記念（野村グループ）数理ファイナンス研究部門」の二つの寄附研究部門を設立し、産業界との連携活動も積極的に行っている。また、内外の国際的な研究者の編集委員と共に国際学術誌 International Journal of Economic TheoryをBlackwellから出版している。